有人批评阿米巴会让企业形成新的“阿米巴墙”，损害企业整体利益。稻城咨询创始人田和喜的回答是：如果一个部门伤害了另一个部门，这种不利的结果会反映在经营会计报表中。比如某个部门的销售额下降了，整个公司的利润下降了。有时，这会鼓励人们反思，给员工施加压力，并产生动力。如果没有改善，就没有生意。华为终端事业部销售负责人直接找制造中心负责人说：“某公司答应元给我增加这些功能，你现在能不能做？不能做我就给他们了。”稻城咨询创始人田和喜认为，促进整个企业成长的唯一途径就是躺着睡觉，这不是阿米巴想要的。应以内部竞争促进外部竞争。
一个企业的发展离不开高质量的经营管理。当前，我国制造业面临创新能力不足、产品附加值低、高端人才缺乏、成本上升、利润下降等问题。引进阿米巴经营管理可为公司快速培养管理人才，在公司内部深入贯彻“销售额最大化，资金最小化”的经营方针，通过自身转型和组织变革，提升公司的市场竞争力。
服务企业纷纷引入阿米巴经营模式，将稻盛和夫的“尊重自然、关爱他人、利他主义”落实到经营活动中，让员工发展“用户思维”，培养“成本意识”和“管理”。意识”，打造企业差异化竞争优势。
行业属性对使用阿米巴进行业务运营有什么影响吗？答案当然是肯定的。不同的行业属性确实会对阿米巴操作的难度产生影响，不同的业务属性和公司结构也会产生影响。不过，这只影响阿米巴模型的使用难度，不会影响阿米巴模型可以使用的程度。比如，在房地产行业实施阿米巴原虫操作，天生就比较困难。不管是什么行业，毕竟是靠人来做的，哪怕是不招高薪能人的行业，也不可能缺普通草根员工。
